Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ssuh2Q8C3L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ssuh2Q8C3L1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ssuh2Q8C3L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms