Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac7Q8C2B3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac7Q8C2B3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac7Q8C2B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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