Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa22Q8C1N8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa22Q8C1N8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa22Q8C1N8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms