Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SowahcQ8C0J6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SowahcQ8C0J6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SowahcQ8C0J6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SowahcQ8C0J6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SowahcQ8C0J6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SowahcQ8C0J6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SowahcQ8C0J6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms