Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Skor1Q8BX46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Skor1Q8BX46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Skor1Q8BX46 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skor1Q8BX46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms