Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx1bQ8BX32 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx1bQ8BX32 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx1bQ8BX32 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slx1bQ8BX32 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx1bQ8BX32 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms