Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Triml1Q8BVP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Triml1Q8BVP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Triml1Q8BVP1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Triml1Q8BVP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms