Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap20Q8BTU1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap20Q8BTU1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap20Q8BTU1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap20Q8BTU1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms