Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19,42■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19,42■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,38■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Ap3s2Q8BSZ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19,31■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19,29■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19,27■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,27■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19,27■□□□□ 0,68
Ap3s2Q8BSZ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Ap3s2Q8BSZ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Ap3s2Q8BSZ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19,26■□□□□ 0,67
Ap3s2Q8BSZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Ap3s2Q8BSZ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,1 ms