Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcns3Q8BQZ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcns3Q8BQZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcns3Q8BQZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcns3Q8BQZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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