Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd3Q8BMP6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd3Q8BMP6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd3Q8BMP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms