Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgtaQ8BJU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgtaQ8BJU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SgtaQ8BJU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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