Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vipas39Q8BGQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vipas39Q8BGQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vipas39Q8BGQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vipas39Q8BGQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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