Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jmjd4Q8BFT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Jmjd4Q8BFT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jmjd4Q8BFT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Jmjd4Q8BFT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jmjd4Q8BFT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms