Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
TnnQ80Z71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TnnQ80Z71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TnnQ80Z71 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TnnQ80Z71 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TnnQ80Z71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TnnQ80Z71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms