Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh8Q80Y20 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh8Q80Y20 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh8Q80Y20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh8Q80Y20 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms