Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ell3Q80VR2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ell3Q80VR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ell3Q80VR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ell3Q80VR2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ell3Q80VR2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms