Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR8

Dcaf1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf1Q80TR8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Dcaf1Q80TR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Dcaf1Q80TR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Dcaf1Q80TR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Dcaf1Q80TR8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC43,07■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,06■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,03■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Dcaf1Q80TR8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,98■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,97■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Dcaf1Q80TR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC42,93■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC42,89■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,89■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42,88■■■■■ 4,46
Dcaf1Q80TR8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC42,88■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC42,86■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,82■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC42,82■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Dcaf1Q80TR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC42,82■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC42,8■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,78■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC42,78■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC42,77■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC42,76■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC42,76■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC42,76■■■■■ 4,44
Dcaf1Q80TR8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Dcaf1Q80TR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Dcaf1Q80TR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Dcaf1Q80TR8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC42,68■■■■■ 4,42
Dcaf1Q80TR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Dcaf1Q80TR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
Dcaf1Q80TR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC42,66■■■■■ 4,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms