Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC48.39■■■■■ 5.34
NischQ80TM9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
NischQ80TM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.31■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC48.27■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC48.26■■■■■ 5.32
NischQ80TM9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC48.25■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC48.24■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
NischQ80TM9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.17■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
NischQ80TM9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC48.12■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NischQ80TM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
NischQ80TM9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
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