Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnf1Q7TSH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnf1Q7TSH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnf1Q7TSH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms