Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf516Q7TSH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf516Q7TSH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf516Q7TSH3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms