Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn1Q7TPR4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn1Q7TPR4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Actn1Q7TPR4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms