Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkd1l2Q7TN88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkd1l2Q7TN88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd1l2Q7TN88 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.5 ms