Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eci3Q78JN3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eci3Q78JN3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms