Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3bQ6ZQ18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3bQ6ZQ18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3bQ6ZQ18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms