Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ino80Q6ZPV2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ino80Q6ZPV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ino80Q6ZPV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ino80Q6ZPV2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ino80Q6ZPV2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms