Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Glis3Q6XP49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Glis3Q6XP49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Glis3Q6XP49 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Glis3Q6XP49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms