Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AY358078Q6UY53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AY358078Q6UY53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms