Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc154Q6RUT8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc154Q6RUT8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc154Q6RUT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc154Q6RUT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms