Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt9Q6RHW0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt9Q6RHW0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms