Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bnip1Q6QD59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip1Q6QD59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bnip1Q6QD59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms