Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp49Q6P9L4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp49Q6P9L4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms