Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC061212Q6P8K3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC061212Q6P8K3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms