Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc148Q6P5U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc148Q6P5U8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc148Q6P5U8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc148Q6P5U8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc148Q6P5U8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms