Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam222bQ6P539 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam222bQ6P539 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam222bQ6P539 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms