Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nsd3Q6P2L6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsd3Q6P2L6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nsd3Q6P2L6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nsd3Q6P2L6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nsd3Q6P2L6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsd3Q6P2L6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms