Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec23ipQ6NZC7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec23ipQ6NZC7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23ipQ6NZC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms