Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CltbQ6IRU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CltbQ6IRU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms