Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Jmjd1cQ69ZK6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms