Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q66JV7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q66JV7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q66JV7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q66JV7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q66JV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q66JV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q66JV7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q66JV7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q66JV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q66JV7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q66JV7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q66JV7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q66JV7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q66JV7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q66JV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q66JV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q66JV7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q66JV7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q66JV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q66JV7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q66JV7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q66JV7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q66JV7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q66JV7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q66JV7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q66JV7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q66JV7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q66JV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q66JV7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q66JV7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q66JV7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q66JV7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q66JV7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q66JV7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q66JV7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q66JV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q66JV7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q66JV7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q66JV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q66JV7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q66JV7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q66JV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q66JV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q66JV7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q66JV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q66JV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q66JV7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q66JV7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q66JV7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q66JV7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q66JV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q66JV7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q66JV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q66JV7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q66JV7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q66JV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q66JV7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q66JV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q66JV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q66JV7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q66JV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q66JV7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q66JV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q66JV7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms