Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8eQ66JT1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8eQ66JT1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc8eQ66JT1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc8eQ66JT1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms