Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a3Q64518 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2a3Q64518 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms