Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf4Q64310 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Surf4Q64310 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms