Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp248Q640N4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp248Q640N4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zfp248Q640N4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Zfp248Q640N4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zfp248Q640N4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp248Q640N4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zfp248Q640N4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zfp248Q640N4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp248Q640N4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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