Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc18Q640L5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Ccdc18Q640L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc18Q640L5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc18Q640L5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
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