Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zic2Q62520 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zic2Q62520 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zic2Q62520 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms