Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vil1Q62468 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vil1Q62468 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vil1Q62468 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.4 ms