Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad2Q62432 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad2Q62432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad2Q62432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad2Q62432 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad2Q62432 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad2Q62432 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad2Q62432 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad2Q62432 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms