Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3gl2Q62420 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3gl2Q62420 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3gl2Q62420 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3gl2Q62420 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms