Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpd52Q62393 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52Q62393 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52Q62393 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52Q62393 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms